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Xba I
产品性质
Quality Level【质量水平】 | 100 |
biological source【生物来源】 | Xanthomonas campestris |
form【形式】 | solution |
packaging【包装】 | pkg of 1,000 U (10674257001 [10 U/μl]) pkg of 20,000 U (10674273001 [10 U/μl]) pkg of 20,000 U (11047663001 [40 U/μl]) pkg of 5,000 U (10674265001 [10 U/μl]) |
manufacturer/tradename | Roche |
parameter【参数】 | 37 ℃ optimum reaction temp. |
technique(s) | DNA sequencing: suitable |
shipped in【运输】 | dry ice |
storage temp.【储存温度】 | −20℃ |
基本信息
General description【一般描述】 | Xba I可识别序列T↓*CTAGA并产生具有 5′-粘性末端的片段。该酶在切割位点之前,需要目标序列周围至少有两个核苷酸。 相容末端 Xba I末端与Avr I、Nhe I和Spe I生成的片段相容。 同裂酶 尚不清楚该酶是否具有同裂酶。 甲基化敏感性 DNA的Xba I消化受到大肠杆菌的dam基因产物的抑制,该基因产物使GATC序列中腺嘌呤的6N位置甲基化。在识别序列的标注位点 (*) 上的5-甲基胞嘧啶或5-羟甲基胞嘧啶也能抑制该酶活性。 在SuRE/Cut缓冲液体系中的活性 建议使用粗体印刷的缓冲液以获得最佳活性: A B L M H 100% 75-100% 75-100% 75-100% 100% 在完全PCR混合液中的相对活性 在PCR混合液(Taq DNA聚合酶缓冲液)中的相对活性为60%。PCR混合液含有?DNA、引物、10mM Tris-HCl(pH 8.3,+20℃)、50mM KCl、1.5mM MgCl2、200 ?M dNTP、2.5 U Taq DNA聚合酶。该混合液可用于25个扩增循环。在Pwo SuperYield DNA聚合酶PCR混合液的反应缓冲液中的活性为25%。当补充GC-RICH溶液时,活性增加至100%。 孵育温度 +37℃ 不同DNA的切割位点数量 λ Ad2 SV40 ?X174 M13mp7 M13mp18 pBR322 pBR328 pUC18 1 5 0 0 0 1 0 0 1 经PFGE测试 Xba I已经过脉冲场凝胶电泳(在细菌染色体上)测试。对包埋在PFGE分析用琼脂糖中的基因组DNA(大肠杆菌C 600)进行切割时,我们建议每 ?g DNA使用10 U酶,孵育时间约为4小时。 连接和再酶切测定 将通过完全消化1 ?g pUC18 DNA获得的Xba I片段与10 ?l的1U T4 DNA连接酶连接,连接方法是在66 mM Tris-HCl溶液(含 5 mM MgCl2、5 mM二硫苏糖醇、1 mM ATP,在+20℃下pH 7.5)中在+ 4℃下孵育16小时,得到pUC18 DNA回收率高于90%。 随后用Xba I重新酶切,得到高于95%的典型pUC18×Xba I片段。 |
Specificity【特异性】 | 星号活性 在低离子强度下或向孵育混合液中添加甘油、乙醇或DMSO,会降低Xba I的序列特异性。 识别位点:TCTAGA TCTAGA 限制性位点:T↓CTAGA T↓CTAGA 热灭活:通过在65℃温育15分钟(最多15 U/μg DNA),可将Xba I热灭活。这些条件不能使较高浓度的Xba I完全热灭活。 |
Application【应用】 | 限制酶Xba I已被用于基因组DNA的消化。 |
DNA Profile【DNA图谱分析】 | 不同DNA的切割位点数量
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Unit Definition【单位定义】 | 一个酶活性单位是指在+37 ℃下,在总体积为50 μl的(1x) SuRE/Cut 缓冲液 H中,在一小时内完全裂解1 μg λdam– DNA所需的酶量。 |
Analysis Note【分析说明】 | SuRE/Cut 缓冲液体系 建议使用粗体印刷的缓冲液以获得最佳活性
在PCR缓冲液中的活性:60% 在PCR混合液(Taq DNA聚合酶缓冲液)中的相对活性为60%。PCR混合液含有λDNA、引物、10mM Tris-HCl(pH 8.3,20℃)、50mM KCl、1.5mM MgCl2、200 μM dNTP、2.5 U Taq DNA聚合酶。该混合液可用于25个扩增循环。在Pwo SuperYield DNA聚合酶PCR混合液的反应缓冲液中的活性为25%。当补充GC-RICH溶液时,活性增加至100%。Pwo SuperYield DNA聚合酶PCR混合液不在美国出售。 无非特异性核酸内切酶活性 将1μg λDNA 与过量的Xba I一起在50 μl SuRE/Cut 缓冲液H中孵育16小时。分析证书提供了不改变酶特异性模式的酶单位数量。 无核酸外切酶活性 将大约5 μg [3H]标记的小牛胸腺DNA与3μl Xba I一起溶于总体积为100 μl的50mM Tris-HCl溶液(含10 mM MgCl 2、1mM二硫赤藓糖醇,pH约7.5)中 并在+ 37℃下孵育4小时。根据分析证书所述,在这些条件下,检测不到放射性释放。 |
Other Notes【其他说明】 | 仅用于生命科学研究。不可用于诊断。 |
Components【组分】 | 组份不可单独销售 Enzyme Solution SuRE/Cut Buffer H 10x concentrated |
安全信息
Storage Class Code【储存分类代码】 | 12 - Non Combustible Liquids |
WGK | WGK 1 |